标签:计算生物学
GenomeComp
GenomeComp官网入口网址,中科院生物物理所生物信息实验室推出的可视化的微生物基因组比较工具,
EMBOSS
EMBOSS官网入口网址,欧洲分子生物学开放软件包,一个开源的序列分析软件包,
PAML
PAML官网入口网址,一款利用最大似然法对DNA或蛋白质序列进行系统发育分析的软件包,
Lammps
分子动力学相关的一些计算和模拟工作,
FASTA
通过搜索蛋白质或DNA数据库,或通过识别序列中的局部重复,找到蛋白质或DNA序列之间的局部或全局相似性区域,
ABySS
ABySS官网入口网址,一个短序列的从头拼接软件,
HISAT2
HISAT2官网入口网址,是一种快速灵敏的比对程序,用于将下一代测序读数(包括DNA和RNA)映射到人类基因组群体(以及单个参考基因组),
EGO
EGO官网入口网址,模拟蛋白质的并行分子动力学计算程序,
MrBayes
MrBayes官网入口网址,使用贝叶斯方法构建系统发育树,
MUMmer
MUMmer官网入口网址,一个快速比对两个基因组序列的软件,